Mission und Zweck der Messerli Stiftung ist die Erhaltung einer natürlichen Umwelt für Mensch und Tier sowie die Kinderhilfe. Konkret bedeutet dies:
- Unterhalt eines Berggasthofes und Biobauernbetriebes im luzernischen Entlebuch, um Naturfreunden zu moderaten Preisen die schöne Natur näher zu bringen.
- Unterhalt eines Forschungsinstitutes an den Wiener Universitäten, um die Mensch-Tier-Beziehung wissenschaftlich zu untersuchen und daraus gewonnene Erkenntnisse dem Publikum zugänglich zu machen.
- Hilfe an bedürftige, arme und verwaiste Kinder.
Die Stiftung ist gemeinnützig.